New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 551684 = | 38 (1.030) | 4 (0.110) | 3/244 | NT | 11.1% | intergenic (+13/‑203) | cysK/sul | cysteine synthase/dihydropteroate synthase, subunit A |
? | CP000730 | 551723 = | 28 (0.800) | intergenic (+52/‑164) | cysK/sul | cysteine synthase/dihydropteroate synthase, subunit A |
CAGGTGCTGCGATTTATGCTGCCATTCAAAAAGCAAAAGAATTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACATACTAATAA > CP000730/551544‑551823 | tgtttaactctaataaaatttactcctgctatttactagttattagtatgtacgtttattatcttatcattcactggatatttttatcagaaaaatgtttaatttaacgctcatatttttaaaaatatacatggtagaaaa > 1:117067‑M1/141‑141 (MQ=255) ggTGCTGCGATTTATGCTGCCATTCAAAAAGCAAAAGAATTAAGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGACGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTATATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTaaa < 2:366255/141‑1 (MQ=255) gctgcGATTTATGCTGCCATTCAAAAAGCAAAAGAATTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAaga > 2:223065/1‑141 (MQ=255) tttATGCCGCCATTCAAAAAGCAAAAGGATTAGGCAAAGGTCACACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGGAACTGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAgagtgaggt > 2:411915/1‑139 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaaGCAAAAGAATTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAAc > 2:230854/1‑141 (MQ=255) aaGAATTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCtt > 1:372900/1‑141 (MQ=255) agttattagtatgtacgtttattatcttatcattcactggatatttttatcagaaaaatgtttaatttaacgctcatatttttaaaaatatacatggtagaaaAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCttt > 1:198349‑M1/104‑141 (MQ=255) gAATTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCtttt > 2:164718/1‑141 (MQ=255) aaTTAGGAAAAGTTAAAACACTAGTAACAGTATTGCCGAGAAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTTATTCGATGACTCTTTAATCTCTTTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGTTAACTTGCTCttttt < 2:84346/141‑1 (MQ=255) aaTTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATATAATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCttttt < 2:29447/141‑1 (MQ=255) aTTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCtttttt < 2:76373/141‑1 (MQ=255) gAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTAc > 2:71330/1‑141 (MQ=255) aGGTAAAACAGTGGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATg < 2:366805/141‑1 (MQ=255) aGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATg < 1:85053/141‑1 (MQ=255) ggTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGt > 1:226789/1‑141 (MQ=255) 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(MQ=255) gCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTTAGATAACTTGCTCTTTTTTTTTTTCATGTATATTTTTAATAATATGAGCGtt > 2:125716/1‑141 (MQ=255) gcgTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTTATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGttaaa > 2:326794/3‑141 (MQ=255) tGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAAc > 2:452390/1‑141 (MQ=255) ggTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACa > 1:229253/1‑141 (MQ=255) tACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGa < 2:56717/141‑1 (MQ=255) aTCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATaaaa < 1:110545/141‑1 (MQ=255) aaCACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTCACTGCAACATGTTTCTGATAAAAata < 2:457747/141‑1 (MQ=255) ccTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCa > 1:381618/1‑141 (MQ=255) tatTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGCAt > 2:334355/1‑141 (MQ=255) ttcGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTTATAAAAATATCCAGTGAATgataag < 2:196859/141‑1 (MQ=255) aattaatGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGAATGATAAGATAATAAAcc > 2:239843/1‑140 (MQ=255) atggtagaaaAAAAGAGCAAGTTATCTCAAAAAGATAACTCACTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTTATAAAAATATCTAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACa < 2:240964‑M1/131‑1 (MQ=255) tggtagaaaAAAAGAGCAAGTTATCTCAAAAAGATAACTCACTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACAt < 2:328785‑M1/132‑1 (MQ=255) tggtagaaaAAAAGAGCAAGTTATCTCAAAAAGATAACTCACTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACAt < 2:21326‑M1/132‑1 (MQ=255) atGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTTTAATTATGTGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATACAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACAt > 2:177073/1‑141 (MQ=255) atGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTACTACCTTGTATATTTGTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACAt < 1:316792/141‑1 (MQ=255) tGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACATa < 1:30357/141‑1 (MQ=255) tAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTTTACCTTGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTGTGATTAAAATATCCAGTGAATTATAAGATAAGTAACGTACAtactaagaa < 2:83680‑M1/140‑4 (MQ=255) | CAGGTGCTGCGATTTATGCTGCCATTCAAAAAGCAAAAGAATTAGGAAAAGGTAAAACAGTAGTAACAGTATTGCCGAGTAATGGTGAACGCTACTTATCAACACCTTTATATTCATTCGATGACTAATTAATGTCATTTAAAAGAGTGAGTTATCTTTTTGAGATAACTTGCTCTTTTTTTCTACCATGTATATTTTTAAAAATATGAGCGTTAAATTAAACATTTTTCTGATAAAAATATCCAGTGAATGATAAGATAATAAACGTACATACTAATAA > CP000730/551544‑551823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |