| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 62,818 | +CAATTT | intergenic (+83/+228) | USA300HOU_0056 → / ← speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 62817 | 0 (0.000) | 30 (0.820) +TCAATT |
21/266 | 0.4 | 100% | intergenic (+82/+229) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase |
| ? | CP000730 | 62818 = | 0 (0.000) | intergenic (+83/+228) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase | |||||
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |