| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP000730 | 62,818 | +CAATTT | intergenic (+83/+228) | USA300HOU_0056 → / ← speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 62817 | 0 (0.000) | 30 (0.820) +TCAATT |
21/266 | 0.4 | 100% | intergenic (+82/+229) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase |
| ? | CP000730 | 62818 = | 0 (0.000) | intergenic (+83/+228) | USA300HOU_0056/speG | hypothetical protein/diamine N‑acetyltransferase | |||||
AAATAGAATTATTAAAACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAA > CP000730/62680‑62944 | aattattaaaacaacgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaatttat > 1:114884‑M2/139‑141 (MQ=255) attaaaacaacgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTAttttt < 1:309586‑M2/7‑1 (MQ=255) taaaacaacgcaaacaaggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTttgt < 2:216840‑M2/9‑1 (MQ=255) aggcttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattggaaatagacaaagataaattgagagtatcgcttaccgcaaagtgaaggatgcgctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGc < 2:314930‑M2/25‑1 (MQ=255) cttactacaaaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctataatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTc < 2:78437‑M2/28‑1 (MQ=255) ataaaaacaatgtttctgtaattctgataccgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTc < 1:348948‑M2/32‑1 (MQ=255) aaaaatgtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTgata < 2:187560‑M2/37‑1 (MQ=255) gtttgtgtaattctgataacgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGt < 2:114884‑M2/43‑1 (MQ=255) acgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCa > 1:230498‑M2/81‑141 (MQ=255) acgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCa > 2:254984‑M2/81‑141 (MQ=255) acgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCa < 1:240096‑M2/61‑1 (MQ=255) acgtcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCa > 1:353602‑M2/81‑141 (MQ=255) tcctattatgttaattgaaacgagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAAt < 1:110134‑M2/64‑1 (MQ=255) tcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAAt < 2:391495‑M2/64‑1 (MQ=255) tcctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAAt < 2:294753‑M2/64‑1 (MQ=255) ctattatgttaattgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCg > 1:52943‑M2/76‑141 (MQ=255) attgaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTAc > 1:100726‑M2/65‑141 (MQ=255) gaaaatagacaaaaataaattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCgt > 1:302712‑M2/62‑141 (MQ=255) aattgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTcatcat > 1:62947‑M2/45‑141 (MQ=255) attgagagcatcccttacctcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAAGAATTGTTTGCAAAGCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcatt < 2:18736‑M2/98‑1 (MQ=255) attgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcatt < 1:50563‑M2/98‑1 (MQ=255) attgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcatt < 2:113211‑M2/98‑1 (MQ=255) tgagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcattca < 1:282623‑M2/100‑1 (MQ=255) gagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcattcat < 2:279635‑M2/101‑1 (MQ=255) gagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcattcat < 1:257270‑M2/101‑1 (MQ=255) gagagcatcccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCAtcattcat < 1:257316‑M2/101‑1 (MQ=255) cccttaccgcaaagtgaaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCt < 2:27256‑M2/109‑1 (MQ=255) aaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAACTCCTCGTAGATTTTATCAAg < 2:192602‑M2/125‑1 (MQ=255) aaggatgctctcaattTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAg < 2:291279‑M2/125‑1 (MQ=255) ggatgctctcaattTATTTTTTTTTTTTTTTTTATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCTTCGTAGTTTTTATCAAGaa > 2:279799‑M2/15‑141 (MQ=255) | AAATAGAATTATTAAAACAACGCAAACAAGGCTTACTACAAAAAATGTTTGTGTAATTCTGATAACGTCCTATTATGTTAATTGAAAATAGACAAAAATAAATTGAGAGCATCCCTTACCGCAAAGTGAAGGATGCTCTATTTTTGTTGAAATTAATATAAGCTTCATTCTGATAGATAGTCATTAATAATTGTTTGCAAATCGTTATTAAGTACCGTTGTTACAGCGTCATCATTCATAAAATCCTCGTAGATTTTATCAAGAA > CP000730/62680‑62944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |