| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2476442 = | 67 (0.950) | 4 (0.060) | 4/246 | 9.9 | 6.2% | intergenic (‑187/+53) | tcaA/tcaR | teicoplanin resistance protein TcaA/transcriptional regulator TcaR |
| ? | CP000730 | 2476489 = | 61 (0.950) | intergenic (‑234/+6) | tcaA/tcaR | teicoplanin resistance protein TcaA/transcriptional regulator TcaR | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATACAATTCAAGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGTTCT > CP000730/2476355‑2476627 | aTACAATTCAAGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAAcc < 2:47801/141‑1 (MQ=255) aCAATTCAAGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTa < 1:730508/141‑1 (MQ=255) cAATTCAAGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTAt > 2:817841/1‑141 (MQ=255) aaTTCAAGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTAtt < 2:759543/141‑1 (MQ=255) cAAGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATg < 2:375976/141‑1 (MQ=255) aGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGAt > 1:10530/1‑141 (MQ=255) aaaTGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTg < 1:253999/141‑1 (MQ=255) aaTGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGc < 1:729567/141‑1 (MQ=255) aTGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCt < 2:19580/141‑1 (MQ=255) aTGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCt < 1:687599/141‑1 (MQ=255) tGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCta > 2:590575/1‑141 (MQ=255) tGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCta > 2:344976/1‑141 (MQ=255) tGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAAATTATTTATGATTGAta > 1:810027/1‑141 (MQ=255) gATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCtat < 1:102744/141‑1 (MQ=255) aTTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCtata < 1:732343/141‑1 (MQ=255) ttAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACAGCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTatat > 1:52448/1‑141 (MQ=255) ttAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTatat > 2:383420/1‑141 (MQ=255) tAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATg > 1:232985/1‑141 (MQ=255) ttactttaGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTCTATGTTTTa < 2:174574/141‑1 (MQ=255) ctttaGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAAtt > 1:568871/1‑140 (MQ=255) ttaGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCg > 1:192716/1‑141 (MQ=255) ttGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGAtgatt < 1:652143/141‑1 (MQ=255) ttGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGAtgatt < 2:573662/141‑1 (MQ=255) gTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGAtgattga > 1:11997/1‑141 (MQ=255) tACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTTTATGTTTTAATGCGAtgattgat > 2:540077/1‑141 (MQ=255) ttattaCATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATCTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACt > 1:500916/1‑141 (MQ=255) ttaCATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCt < 1:810360/141‑1 (MQ=255) tatttatGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACt > 2:629540/1‑141 (MQ=255) atttatGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATTCGATGATTGATGACTTCTAATACtt > 2:726785/1‑141 (MQ=255) atttatGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACtt < 2:807383/141‑1 (MQ=255) ttatGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGc < 1:371046/141‑1 (MQ=255) atGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCt < 1:597706/141‑1 (MQ=255) tGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCtt < 1:649760/141‑1 (MQ=255) gAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATTACTTCTAATACTTGCCTTa > 1:701483/1‑141 (MQ=255) aaGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACa > 1:6369/1‑141 (MQ=255) aCTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACAtttt < 1:817841/141‑1 (MQ=255) tctctcAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCa < 1:262294/141‑1 (MQ=255) tctcAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAat < 1:696867/141‑1 (MQ=255) ttATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTc < 1:265664/141‑1 (MQ=255) taACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGa > 1:843451/1‑141 (MQ=255) aaCTAAAAAGAAGGTGTTCAAAACATTCATAGTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCtttataa > 2:464737/1‑136 (MQ=255) cTAAAAAGAAGGTGTTCAATACTTACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGTTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACACATTCAATATCTTCAGAAtt < 2:246783/141‑1 (MQ=255) cTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAAtt > 2:792070/1‑141 (MQ=255) tAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAAttt < 2:240629/141‑1 (MQ=255) aaaaGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTaa > 2:401495/1‑141 (MQ=255) agGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCAtt < 1:383420/141‑1 (MQ=255) ggTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTa > 1:179627/1‑141 (MQ=255) ggTGTTCAATACATACATATATAGTCTTATAATAGAACACCTTCAAAAACCAATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTa > 2:682006/1‑141 (MQ=255) cAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCaaaaa < 2:178796/43‑1 (MQ=255) cAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCaaaaa > 1:178796/1‑43 (MQ=255) cAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATAATTAGTAata > 1:812208/1‑141 (MQ=255) atacatacATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATc > 1:342381/1‑141 (MQ=255) atacattTTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGGCTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTgc > 2:700330/1‑141 (MQ=255) tacataTTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTgcg > 1:797078/1‑141 (MQ=255) tacataTTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTgcg < 2:511811/141‑1 (MQ=255) atatTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTGAATTATTAGTAATATCTTGCGCaa > 2:480889/1‑141 (MQ=255) atatTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCaa < 1:792070/141‑1 (MQ=255) atatTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCaa > 1:141494/1‑141 (MQ=255) tAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCt < 1:585295/141‑1 (MQ=255) tataTTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATa > 1:614971/1‑141 (MQ=255) atTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATc < 2:609434/141‑1 (MQ=255) tctGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCg < 1:327345/139‑1 (MQ=255) aaCACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCAtt < 2:474497/141‑1 (MQ=255) aaCACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCCGTCATAATCGCAtt > 2:486024/1‑141 (MQ=255) aaCACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCATGCGCAATATCTGTCATAATCGCAtt > 1:144380/1‑141 (MQ=255) acacCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTa < 1:396779/141‑1 (MQ=255) ccTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGt < 2:653864/141‑1 (MQ=255) ccTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGt < 1:726785/141‑1 (MQ=255) ccTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGt > 2:572690/1‑141 (MQ=255) ccTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGt < 1:445253/141‑1 (MQ=255) ccTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGt < 2:178388/141‑1 (MQ=255) ttCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGttt > 2:632288/1‑140 (MQ=255) ttCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGTTc > 1:735824/1‑141 (MQ=255) tCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGTTCt < 2:240931/141‑1 (MQ=255) | ATACAATTCAAGAAATGATTAACTTTACTTTAGAATTGTACCTTATTACATTATTTATGAAAGTACTCTCTCAATTATAACTAAAAAGAAGGTGTTCAATACATACATATTTAGTCTTATATTTGAACACCTTCAAAAACCTATTTATGATTGCTATATGTTTTAATGCGATGATTGATGACTTCTAATACTTGCCTTACATTTTCAATATCTTCAGAATTTAAATCATTAGTAATATCTTGCGCAATATCTGTCATAATCGCATTACGTTCT > CP000730/2476355‑2476627 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |